《心灵医师》的主人公Jack Gallagher医生（Chris Vance扮演）是一位精力充沛、做事风风火火的精神病专家。虽然年纪轻轻，却已在洛杉矶一家著名医院当上了心理健康与诊疗中心的主任。和瘸腿的Gregory House一样，Jack Gallagher性格顽固，桀骜不驯，喜欢采用非传统的「激进方法」甚至「异类方法」来治疗病人。他初次上班，就把医院闹了个天翻地覆。尽管事后证明他的方法非常有效，但生性保守并与Jack有过一段爱情史的女院长Nora Skoff（Annabella Sciorra扮演）却不买他的帐，强烈要求他改用传统方法。

《心灵医师》从一个观众从未见过的角度揭示了人脑的复杂性。对Jack来说，每一集他都要接受一个新的精神病例。陌生的患者，奇异的病状，出乎意料的「危机」，被人误解的诊疗手段以及屡屡偏离正轨的治疗结果，让本剧充满了「趣味性」。Jack必须使出浑身解数来了解病人的历史和现状，探索病人的「深层意识」，然后根据自己的发现来为病人制定「可行的」的长期性恢复方案。Jack最基本的观点就是：精神病人也是人。要治好他们的病，首先要对他们平等相待。

来医院就诊的精神病患者主要分三类情况：第一，被警察带来进行精神评估的「可疑分子」，医院可对他们进行72小时医学观察；第二，自己承认自己是精神病的「怪人」；第三，因为某方面的心理疾病或恐惧症而到医院看精神科门诊的普通患者.